En sus suelos se observa la presencia de sierras calcáreas en el sureste, muy importante para la preservación del área. Su escenario natural presenta un espectacular paisaje en el que alberga una rica gama de flora y fauna. En cuanto a la flora, hasta el momento se ha logrado recolectar 874 especies en el área. La variedad de su fauna es riquísima, convergente de cuatro corrientes.

En San Matías existe un Centro Ecológico que recoge muestras de la enorme diversidad de flora y fauna de toda la región, conformada por diferentes unidades geológicas de gran antigüedad